Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK-24P63145 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms