Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms