Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPA1P15085 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA1P15085 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms