Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms