Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCNKO75909 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms