Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms