Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SIAH2O43255 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms