Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLXNB1O43157 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB1O43157 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms