Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCF2LO15068 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2LO15068 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms