Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC010487.3-201ENST00000634278 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 GALNT15-206ENST00000617544 2775 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SENP3Q9H4L4 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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