Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBE1Q9UJT0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms