Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM53CQ9NYF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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