Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF3Q9H094 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms