Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ROPN1BQ9BZX4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms