Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTERF3Q96E29 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms