Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms