Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC103Q8IW40 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC103Q8IW40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms