Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPOCD1Q6ZMY3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms