Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEP135Q66GS9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms