Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PXDC1Q5TGL8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXDC1Q5TGL8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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