Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC38Q502W7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC38Q502W7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms