Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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