Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IKZF1Q13422 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms