Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt36.61■■■■□ 3.452e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-202ENST00000586270 468 ntTSL 230.54■■■□□ 2.482e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.212e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-209ENST00000589949 842 ntTSL 222.25■■□□□ 1.152e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-207ENST00000589417 575 ntTSL 221.77■■□□□ 1.082e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-205ENST00000587171 586 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.472e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.621e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 OBSL1-208ENST00000465149 5380 ntTSL 223.93■■□□□ 1.421e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.231e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GPS1-206ENST00000578279 875 ntTSL 521.1■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 HSPA9-213ENST00000524109 1175 ntTSL 512.72□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 HSPA9-211ENST00000512328 482 ntTSL 35.15□□□□□ -1.594e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 321.47■■□□□ 1.033e-25■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 PRRC2A-206ENST00000464890 593 ntTSL 218.53■□□□□ 0.562e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 518.07■□□□□ 0.482e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 UPF1-209ENST00000600310 750 ntTSL 423.99■■□□□ 1.431e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 UPF1-206ENST00000598471 582 ntTSL 319.13■□□□□ 0.651e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 UPF1-211ENST00000600868 580 ntTSL 317.79■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 UPF1-205ENST00000598209 551 ntTSL 417.17■□□□□ 0.341e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 UPF1-208ENST00000600012 501 ntTSL 515.48■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF3B-212ENST00000494658 637 ntTSL 221.6■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 TPM4-209ENST00000588483 801 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 FABP1-203ENST00000472846 546 ntTSL 28.56□□□□□ -1.048e-29■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 COPA-203ENST00000481040 578 ntTSL 36.29□□□□□ -1.46e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.468e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.948e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.948e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 320.8■□□□□ 0.928e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.818e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.628e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-208ENST00000588373 1374 ntTSL 218.85■□□□□ 0.618e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.428e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-216ENST00000591831 1406 ntTSL 517.05■□□□□ 0.328e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 WBP2-207ENST00000587642 3718 ntTSL 211.08□□□□□ -0.648e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.227e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.157e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.047e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.247e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.387e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.427e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.077e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.247e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.298e-8■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 HSPD1-213ENST00000486181 648 ntTSL 23.96□□□□□ -1.783e-21■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.295e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 G6PD-209ENST00000490651 783 ntTSL 222.57■■□□□ 1.22e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 322.88■■□□□ 1.254e-8■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 PRMT1-214ENST00000529836 580 ntTSL 317.93■□□□□ 0.464e-8■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 PRMT1-208ENST00000527412 463 ntTSL 39.82□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 TRIM28-205ENST00000595028 486 ntTSL 218.68■□□□□ 0.585e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.066e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 DYNC1H1-202ENST00000553423 539 ntTSL 45.7□□□□□ -1.55e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-230ENST00000510167 857 ntTSL 410.76□□□□□ -0.695e-8■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 CPNE1-228ENST00000498814 550 ntTSL 319.3■□□□□ 0.685e-11■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 TOX4-208ENST00000473176 704 ntTSL 211.53□□□□□ -0.568e-8■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 NDUFS2-204ENST00000467295 1060 ntTSL 326.05■■□□□ 1.762e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-208ENST00000462894 453 ntTSL 332.01■■■□□ 2.718e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.898e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.858e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-204ENST00000415116 739 ntTSL 525.81■■□□□ 1.728e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.948e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-205ENST00000440766 798 ntTSL 220.27■□□□□ 0.848e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.848e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.698e-10■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 BAG6-257ENST00000462875 972 ntTSL 222.37■■□□□ 1.173e-13■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 MACF1-226ENST00000497964 4160 ntTSL 28.63□□□□□ -1.033e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.332e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.362e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.512e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.164e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.124e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.484e-6■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 SON-209ENST00000457208 765 ntTSL 39.11□□□□□ -0.958e-7■□□□□ 10.2
G3BP1Q13283 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 520.4■□□□□ 0.861e-7■□□□□ 10.2
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 23.3 ms