Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBRQ0VD83 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBRQ0VD83 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms