Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITIH3Q06033 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITIH3Q06033 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms