Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms