Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RALAP11233 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RALAP11233 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RALAP11233 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RALAP11233 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RALAP11233 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RALAP11233 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RALAP11233 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RALAP11233 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RALAP11233 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RALAP11233 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms