Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms