Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC90BQ9GZT6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC90BQ9GZT6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms