Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABARAPL3Q9BY60 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms