Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms