Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CR12Q96Q35 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms