Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPTM1LQ96KA5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPTM1LQ96KA5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms