Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms