Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD55Q3KP44 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms