Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms