Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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