Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3AQ14432 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3AQ14432 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3AQ14432 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE3AQ14432 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE3AQ14432 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms