Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC1Q13547 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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