Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRATP43155 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRATP43155 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRATP43155 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRATP43155 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms