Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPOP30536 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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