Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRG2P13727 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms