Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP2C9P11712 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP2C9P11712 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP2C9P11712 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms