Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB7P09629 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms