Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFT2D2O95562 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms