Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NOBOXO60393 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NOBOXO60393 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms