Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRBV24-1A0A075B6N3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRBV24-1A0A075B6N3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRBV24-1A0A075B6N3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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