Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026904.4-201ENST00000523038 559 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025575.2-201ENST00000549357 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092718.2-201ENST00000562315 487 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL444P-201ENST00000578948 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL543P-201ENST00000580506 299 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4442-201ENST00000583412 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145207.4-201ENST00000583521 450 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL44P-201ENST00000583849 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH17-AS1-201ENST00000588565 513 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6785-201ENST00000618984 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCO1-209ENST00000628579 477 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM166B-207ENST00000639789 651 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC7-204ENST00000415775 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB3-201ENST00000394807 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TOP3A-201ENST00000321105 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COL12A1-203ENST00000416123 8964 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ESR1-208ENST00000443427 6357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SULF2-211ENST00000484875 4238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO10-203ENST00000505695 4803 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SALL4-201ENST00000217086 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SHROOM2-202ENST00000418909 4615 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7A-211ENST00000620575 4016 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FMN1-203ENST00000558197 4060 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A3-209ENST00000602133 3458 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG4C-203ENST00000371120 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NSUN7-201ENST00000316607 3546 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms