Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000892.3-201ENST00000624094 5326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO2-201ENST00000307142 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM39-204ENST00000396548 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR1-206ENST00000623527 6781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC90B-214ENST00000529689 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL14-202ENST00000359358 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB3-203ENST00000391911 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087491.1-201ENST00000398554 616 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365356.4-201ENST00000425246 613 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3681HG-203ENST00000429878 558 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000522.1-201ENST00000448070 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359692.1-201ENST00000451069 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL266P-201ENST00000465140 289 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007160.1-201ENST00000488095 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL627309.7-201ENST00000494149 755 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016612.1-201ENST00000505367 289 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P4-201ENST00000506772 381 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA20-201ENST00000516768 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136443.1-201ENST00000526173 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136443.2-201ENST00000528546 258 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP8-205ENST00000534343 726 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB4BP1-201ENST00000545422 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136619.1-201ENST00000564015 258 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3689D2-201ENST00000580187 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011498.1-201ENST00000591414 478 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCC1-AS1-202ENST00000604747 413 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121890.4-201ENST00000616569 609 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK10-222ENST00000625631 140 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX8-201ENST00000263334 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 M1AP-202ENST00000409585 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002490.1-201ENST00000502284 4233 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC33-203ENST00000398814 2787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.9 ms